Molecular Identification and Characterization of Amoeba Species from Different Geographical Regions in The West- Bank, Palestine
| dc.contributor.author | مالك محمد عوض شريف | |
| dc.contributor.author | Malek Mohammad Awad Shareef | |
| dc.date.accessioned | 2023-02-28T12:17:05Z | |
| dc.date.available | 2023-02-28T12:17:05Z | |
| dc.date.issued | 2022-11-27 | |
| dc.description.abstract | ABSTRACT Amoebiasis is one of the most ten common intestinal parasitic diseases worldwide, with Entamoeba histolytica infecting around 500 million people causing 100,000 deaths each year. In Palestine, amoebiasis is reported to be a major health problem, it is routinely diagnosed using microscopy by identification of cysts and trophozoites in fresh stool samples. However, this diagnostic method may result in overestimating the patient numbers infected with E. histolytica, and leads to mistreatment of the nonpathogenic species of Amoeba (E. dispar and E. moshkovskii) that are morphologically indistinguishable from the pathogenic species. In this study we investigated the molecular epidemiology of Amoeba species among Palestinian population in different regions of the West Bank. In addition, we determined the sociodemographic and socioeconomic factors associated with Amoeba infection among patients. A total of 100 stool samples were collected from patients who have been presented to Palestinian Ministry of Health (PMOH) clinics and private labs, patients came with symptoms of intestinal infections (abdominal pain, diarrhea and / or dysentery). Sociodemographic data was collected using questionnaire for patients who were diagnosed with Amoeba infection. The samples were initially analyzed by direct wet mount microscopy and then by PCR with specific primers for detection of E. histolytica, E. dispar, and E. moshkovskii. The PCR results confirmed the diagnosis of E. histolytica in 74 samples, and E. dispar in 29 samples. Mixed infection of both E. histolytica and E. dispar was identified in 7 samples. In a comparison between microscopy and PCR methods for the identification of E. histolytica and E. dispar, 96 positive fecal samples were yielded by PCR while 100 positive samples diagnosed microscopically. Furthermore, PCR confirmed of 74% positive samples diagnosed microscopically are also positive for E. histolytica. The demographic data showed a significant correlation between E. histolytica infection and patient’s age and educational level; where the highest infection rates were found among school and preschool children. Our study highlights the need for additional representative large population-based molecular studies on the distribution and epidemiology of the diseases in Palestine. Further studies on the environmental and behavioral factors of patients should be performed on larger scale to determine the risk factors associated with amoebiasis infection in Palestine. يعدٌّ داء الأميبا أحد أكثر ألامراض الطفيلية والمعوية شيوعًا وانتشاراً في العالم، حيث تصيب الأميبا من نوع المتحولة الحالة للنُسج "Entamoeba histolytica" حوالي 500 مليون شخص حول العالم مسببةً ما يقارب 100,000 حالة وفاة كل عام. وفقاً لإحصائياتٍ أجرتها وزارة الصحة الفلسطينية فإن داء الأميبا يمثل مشكلة صحية كبيرة واسعة الانتشار بين السكان الفلسطينيين في الضفة الغربية وقطاع غزة. يتم تشخيص هذا المرض بشكلٍ روتيني باستخدام الفحص المجهري لفحص وجود الشكل الهاجع "الكيسات" والشكل النشيط "الأتاريف" في عينات البراز الحديثة الإخراج من المريض باستخدام المجهر الضوئي. في معظم الأحيان تؤدي طريقة التشخيص الروتيني باستخدام المجهر إلى زيادةٍ غير دقيقة في تشخيص المصابين بالأميبا المتحولة المسببة للمرض من نوع المتحولة الحالّة للنُسج “E. histolytica”. في هذه الدراسة، قمنا بفحص عينات براز لمرضى يعتقد أنهم مصابون بداء الأميبا من السكان الفلسطينيين المقيمين في تسع مناطق مختلفة من الضفة الغربية وهي الخليل، بيت لحم، نابلس، رام الله، جنين، طولكرم، سلفيت، اريحا والعيزرية باستخدام تقنيات البيولوجيا الجزيئية "PCR". إضافةً إلى ذلك، قمنا بتحديد العوامل الاجتماعية والديموغرافية والاقتصادية المرتبطة بالإصابة بداء الأميبا. بالمجمل، تم جمع 100 عينة براز من المرضى الذين قاموا بمراجعة عيادات وزارة الصحة والمختبرات الخاصة، والذين عانوا أعراض التهابات معوية تشمل الإسهال، ألم تشنجي أو مغص في البطن، الهزال، والحمى. علاوةً على ذلك، قمنا بجمع معلومات ديموغرافية خاصة بالمرضى لأهداف الدراسة باستخدام استبيان تم تعبئته من المعلومات التي قدمها المرضى المشمولين في الدراسة بشكل مباشر. بدايةً، تم فحص العينات باستخدام الفحص المجهري المباشر ثم بواسطة تقنية تفاعلات البلمرة المتسلسلة “PCR” لتحري المادة الوراثية للأميبا في البراز باستخدام مشرعات "Primers" محددة وموثقة للكشف عن الحمض النووي الخاص بالأميبا. أكدت نتائج تفاعلات البلمرة المتسلسلة تشخيص الأميبا من المتحولة الحالّة للنُسج. E. histolytica في 74 عينة والاميبا من نوع المتحولة المتغيرة E. dispar في 29 عينة. كذلك تم الكشف عن عينات تحتوي على نوعيّ الأميبا المذكورين سابقاً معاً في 7 عينات. بالمقارنة بين تقنية الفحص المجهري وتقنية تفاعلات البلمرة المتسلسلة لتشخيص الاميبا المسببة للمرض، أكدت تقنية PCRعلى أنّ 74٪ من العينات الإيجابية التي تم تشخيصها مجهريًا كانت إيجابية أيضًا باستخدام PCR. كما أظهرت البيانات الديموغرافية وجود ارتباط كبير بين العدوى بالأميبا من نوع E. histolytica والفئة العمرية للمريض والمستوى التعليمي له، حيث وجدت أعلى معدلات الإصابة بين أطفال المدارس ومرحلة ما قبل المدرسة. قامت دراستنا بتسليط الضوء على الحاجة الملحة لمزيدٍ من الدراسات باستخدام تقنيات البيولوجيا الجزيئية على عددٍ أكبر من العينات للحصول على صورة أكثر وضوحاُ حول انتشار وتوزيع داء الأميبا في فلسطين. كذلك توصي دراستنا بضرورة إجراء المزيد من الأبحاث حول العوامل البيئية والسلوكية للمصابين على نطاق أوسع لتحديد عوامل من المحتمل ان تكون مرتبطة بعوامل الخطر للإصابة بداء الأميبا في فلسطين | |
| dc.identifier.citation | Further studies on the environmental and behavioral factors of patients should be performed on larger scale to determine the risk factors associated with amoebiasis infection in Palestine 2022 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.alquds.edu/handle/20.500.12213/8154 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | جامعة القدس | |
| dc.title | Molecular Identification and Characterization of Amoeba Species from Different Geographical Regions in The West- Bank, Palestine | |
| dc.title.alternative | التعريف والتوصيف الجزيئي لأنواع الأميبا في مناطق جغرافية مختلفة في الضفة الغربية | |
| dc.type | Animation |